האגף עוסק בהנחיה, בקרה, ביצוע, ביקורות, הדרכות ותרגילים ב 1400 ספקי מים ובהם חברת מקורות מתקני התפלת מים תאגידי מים וביוב רשויות מקומיות אגודות מים קיבוצים מושבים וישובים קהילתיים ועוד. האגף מייצר חומרים רבים כגון: דוחות, ביקורות, סיכומי תרגיל  ועוד. בימים אלו מקימה רשות המים מערכת שליטה ובקרה אשר תככלול את הנתונים המצוינים לעיל יחד עם יכולות לשליטה ובקרה בחרום כולל הזרמת נתוני אמת מערכות GIS ועוד למערכת.